Na pierwszy rzut oka agencje brandingowe i marketingowe mogą wydawać się zbliżone, ale istnieją istotne różnice między nimi. Agencja brandingowa i marketingowa różnią się zarówno sposobem działania, jak i zakresem zadań. Ważne jest zrozumienie, że ich działania są ściśle powiązane. Agencja brandingowa skupia się na kreowaniu marki, jej wizerunku oraz wspiera w opracowaniu strategii rozwoju. Natomiast agencja marketingowa odpowiada za kontakt z grupą docelową, wykorzystując przygotowaną przez agencję brandingową strategię i identyfikację wizualną do prowadzenia działań promocyjnych.

W rezultacie przedsiębiorstwa zazwyczaj najpierw współpracują z agencją brandingową. Dopiero po wypracowaniu tożsamości marki i nadaniu jej osobowości agencja marketingowa wkracza do akcji. Jej zadaniem jest prowadzenie kampanii marketingowych zarówno offline, jak i online, skupiających się na komunikacji i promocji.